Detection and Characterization of Ribosome-Associated Long Noncoding RNAs

Chao Zeng, Michiaki Hamada*

*この研究の対応する著者

研究成果: Chapter

抄録

Ribosome profiling shows potential for studying the function of long noncoding RNAs (lncRNAs). We introduce a bioinformatics pipeline for detecting ribosome-associated lncRNAs (ribo-lncRNAs) from ribosome profiling data. Further, we describe a machine-learning approach for the characterization of ribo-lncRNAs based on their sequence features. Scripts for ribo-lncRNA analysis can be accessed at (https://ribolnc.hamadalab.com/ ).

本文言語English
ホスト出版物のタイトルMethods in Molecular Biology
出版社Humana Press Inc.
ページ179-194
ページ数16
DOI
出版ステータスPublished - 2021

出版物シリーズ

名前Methods in Molecular Biology
2254
ISSN(印刷版)1064-3745
ISSN(電子版)1940-6029

ASJC Scopus subject areas

  • 分子生物学
  • 遺伝学

フィンガープリント

「Detection and Characterization of Ribosome-Associated Long Noncoding RNAs」の研究トピックを掘り下げます。これらがまとまってユニークなフィンガープリントを構成します。

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